肠道病毒71型VP1外壳蛋白二级结构及B细胞表位预测
蒋建平
王来
李宜川
高明灿
1.商丘医学高等专科学校基础医学部,河南商丘,4761002.商丘医学高等专科学校基础医学部,河南商丘,4761003.商丘医学高等专科学校基础医学部,河南商丘,4761004.商丘医学高等专科学校基础医学部,河南商丘,476100
摘要:目的 预测肠道病毒71型(EV71)外壳蛋白VP1二级结构和B细胞表位,为制备EV71疫苗的研究提供理论基础.方法 应用GOR4、HNN、SOPMA、nnPredict等方法预测EV71 VP1二级结构,并结合亲水性、柔韧性、表面可能性和吴氏抗原指数法综合预测潜在的B细胞表位. 结果 EV71 VP1二级结构以无规卷曲和β-片层为主,含有少量的α-螺旋,少见β-转角; EV71 VP1潜在的B细胞表位很可能位于第67~71位氨基酸残基.结论 联合多种生物信息学方法成功预测了EV71 VP1二级结构和B细胞表位;此为制备EV71疫苗的研究提供了理论基础.
关键词:手足口病肠道病毒VP1二级结构B细胞表位
分类号:R373.2(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
资助基金:河南省教育厅自然科学研究计划项目(2008C310007)
论文发表日期:2009-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:3( 10-12 )
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山东医药

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ISSN:1002-266X
年,卷(期):2009,49(35)
所属栏目:论著