KNN法在含纤连蛋白域蛋白质亚细胞定位中的应用
李立奇1
张瑗1
周跃1
王开发2
1.第三军医大学新桥医院,重庆,4000372.第三军医大学计算机教研室
摘要:目的 探讨K最近邻(KNN)法在含纤连蛋白(FN)域蛋白质亚细胞定位中的应用价值.方法 选取含FN域蛋白质80个(40个细胞外蛋白质和40个细胞内蛋白质),采用KNN法进行蛋白质亚细胞定位,并采用jackknife检验法和5维交叉验证法检验样本的定位的准确率.结果 KNN法定位细胞内蛋白36个,细胞外蛋白35个.jackknife法检验KNN法蛋白质定位准确率为88.75%, 5维交叉法验证其定位准确率为82.5%.结论 利用KNN法可较准确的预测含FN域蛋白质的亚细胞位置.
关键词:K最近邻法纤连蛋白亚细胞定位氨基酸组成
分类号:R604(外科诊断学)
资助基金:国家自然科学基金(30901512)
论文发表日期:2011-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:2( 20-21 )
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山东医药

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ISSN:1002-266X
年,卷(期):2011,51(2)