激素性股骨头坏死患者血浆 microRNA表达谱及生物信息分析
孙楠1
樊粤光1
李鹏飞1
曾意荣2
曾建春2
1.广州中医药大学,广州,5104052.广州中医药大学第一附属医院
摘要:目的:分析激素性股骨头坏死( SONFH)患者血浆microRNA表达谱变化及生物信息内容,并探讨其意义。方法选取SONFH患者(观察组)和健康志愿者(对照组)各6例,采用Real-time PCR法检测其血浆microR-NA相对表达量,筛选差异表达的microRNA。采用TargetScan、mirBase及miRanda三个在线数据库预测交集靶基因,分别进行功能富集性分析和信号转导通路富集(Pathway)分析。结果共检测768个microRNA,两组差异表达的microRNA 16个,其中观察组上调10个,比较明显的是hsa-miR-1207-5p和hsa-miR-887(观察组/对照组>3);下调6个,比较明显的是hsa-miR-96-5p、hsa-miR-576-5p(观察组/对照组<0.5)。三个在线数据库共筛选出交集靶基因887个,其中上调microRNA 483个,hsa-miR-1207-5p未检出交集靶基因,hsa-miR-887检出交集靶基因为GSK3A和CASK;下调microRNA 404个,hsa-miR-96-5p检出交集靶基因114个,hsa-miR-576-5p检出59个。功能富集性分析显示,两组差异表达microRNA调控的靶基因功能主要包括解剖结构形态、间充质细胞增殖、细胞代谢过程等, Pathway分析显示靶基因明显富集于各种信号通路。结论 SONFH患者血浆microRNA 明显上调的是hsa-miR-1207-5p和hsa-miR-887,明显下调的是hsa-miR-96-5p、hsa-miR-576-5p,microRNA异常表达可能通过各信号通路参与SONFH的发病。
关键词:股骨头坏死糖皮质激素微小RNA基因表达谱
分类号:R681.8(骨科学(运动系疾病、矫形外科学))
资助基金:国家自然科学基金(81373652)
论文发表日期:2015-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 1-4 )
英文信息展开
山东医药

山东医药

北大核心CSTPCD
ISSN:1002-266X
年,卷(期):2015,(48)
所属栏目:论著