胃癌组织 ATP1 A2的表达及机制探讨
李智
王硕
侯科佐
臧丹
郑春雷
车晓芳
曲秀娟
刘云鹏
1.中国医科大学附属第一医院,沈阳,1100012.中国医科大学附属第一医院,沈阳,1100013.中国医科大学附属第一医院,沈阳,1100014.中国医科大学附属第一医院,沈阳,1100015.中国医科大学附属第一医院,沈阳,1100016.中国医科大学附属第一医院,沈阳,1100017.中国医科大学附属第一医院,沈阳,1100018.中国医科大学附属第一医院,沈阳,110001
摘要:目的:观察胃癌组织ATP酶α2亚基( ATP1A2)表达情况,探讨其与黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子通路、细胞外基质相关信号通路的关系。方法从癌症基因组图谱( TCGA)数据库下载并预处理胃癌RNASeqV2数据、从人类肿瘤相关基因表达汇编( GEO)数据库下载胃癌样本数据集GSE62254的series matrix数据,通过TCGA数据集纳入胃癌患者293例,通过GEO数据集纳入胃癌患者300例。根据表达谱数据,将胃癌组织ATP1A2表达由低到高排序,按33%、67%者将数据三等分,低于33%者为低表达,高于67%者为高表达,两者之间为中表达。分析不同ATP1A2表达与胃癌患者临床病理参数的关系,比较低、中、高表达者中位生存时间,利用基因集富集分析方法预测ATP1A2相关的基因通路。结果 TCGA数据集纳入的293例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为95、99、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄无关(P均>0.05),与T分期、N分期、pTNM分期及组织分化程度有关(P均<0.05);ATP1A2低、中、高表达者中位生存时间分别为70、36.9和26个月,三者间比较P<0.01。 GEO数据集纳入的300例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为99、102、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄、T分期、N分期、pTNM分期及Lauren分型均有关(P均<0.05);ATP1A2高表达者的中位生存时间为31个月,较低表达和中表达者中位生存时间明显延长(P<0.01)。 ATP1A2高表达富集了黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等相关的基因通路(P<0.05或<0.01)。结论胃癌组织中ATP1A2高表达,其高表达预示患者预后不良;ATP1A2高表达导致黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等基因通路异常可能是其作用机制。
关键词:胃癌癌症基因组图谱人类肿瘤相关基因表达汇编ATP酶α2亚基
分类号:R735.2(消化系肿瘤)
资助基金:国家自然科学基金(81302023)重大新药创制"科技重大专项(2013ZX09303002)辽宁省科技计划(2014225013)
论文发表日期:2016-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 5-8 )
英文信息
