卵巢癌HELQ蛋白结构和功能的生物信息学工具分析预测
李亚萍1
邹余粮2
张琳1
黄新1
秦勇1
1.西安市中心医院,西安,7100032.西安交通大学第一附属医院
摘要：目的 预测卵巢癌抑癌基因HELQ编码蛋白(HELQ蛋白)的结构和功能.方法 采用ExPASy服务器中的工具分析HELQ蛋白的理化特征.分别采用PSORTⅡ和TMHMM预测HELQ蛋白的亚细胞定位和跨膜拓扑结构.采用SignalP 4.0预测HELQ蛋白的信号肽.采用ScanProsite和SMART分析HELQ蛋白的功能结构域以及结构域分区.采用PSIPRED和I-TASSER预测HELQ蛋白的二级和三级结构以及配体结合位点.采用STRING 10.0预测HELQ蛋白与其他蛋白的交互作用.结果 HELQ蛋白主要定位在细胞核(47.8%)和细胞质(39.1%)中,有4个保守结构域DEXDc、HELICc、HHH_5和PRK02362,并包含解旋酶ATP结合区和解旋酶C端结合区两个功能结构域;成功建立了HELQ蛋白的二级和三级结构模型,其中二级结构中α螺旋、无规则卷曲及折叠结构比例分别为54%、31%和6%.三维配体结构分析发现HELQ蛋白包含一个酶活性中心位点His341,催化Ile333、Lys335、Tyr337、Gln340、Pro360、Thr361、Ser362、Gly363、Gly364、Lys365、Thr366、Leu367、Glu464和Ala711等结合位点与配体ATP结合.交联蛋白质分析发现HELQ蛋白可能与RAD51、POLA1、PLON、FANCD2、DHX8等蛋白存在交互作用.结论 HELQ蛋白可能具有ATP依赖性解旋酶的结构和功能,参与DNA损伤的修复过程.
关键词：卵巢癌HELQ基因HELQ蛋白三级结构ATP依赖性解旋酶
分类号：R737.3(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：陕西省科学技术研究发展计划(2013JM4064)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 29-32 )
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