阿尔茨海默病患者外周血和脑组织GPI基因表达观察及其功能的生物信息学分析
马国维
钟欣
杜可
宫世强
刘明妍
魏敏杰
1.中国医科大学药学院,沈阳,1101222.中国医科大学药学院,沈阳,1101223.中国医科大学药学院,沈阳,1101224.中国医科大学药学院,沈阳,1101225.中国医科大学药学院,沈阳,1101226.中国医科大学药学院,沈阳,110122
摘要：目的 基于GEO芯片技术观察阿尔茨海默病(AD)患者外周血和脑组织磷酸葡萄糖异构酶(GPI)基因的表达情况,分析GPI基因的功能及其与AD发病的关系.方法 获取健康老年人大脑额叶皮质样本18例份、颞叶皮质样本19例份、海马样本19例份、外周血样本14例份及AD患者大脑额叶皮质样本15例份、颞叶皮质样本10例份、海马样本29例份、外周血样本14例份.利用GEO数据库筛选适用于AD的相关芯片,检测健康老年人及AD患者外周血、脑组织样本GPI基因.借助蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图筛选GPI的相关基因;通过基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,筛选GPI基因可能参与并主要影响的生物学功能或通路.结果 外周血芯片分析结果显示,健康老年人中,女性外周血GPI基因表达量低于男性,且低于男性AD患者(P均＜0.05);相同性别人群中,AD患者外周血GPI基因表达量低于健康老年人(P均＜0.05).脑组织芯片分析结果显示,AD患者海马组织GPI基因表达明显下调,低于额叶、颞叶皮质(P均＜0.05);GPI基因表达量随AD病情加重而持续减少(P均＜0.05).通过PPI网络图,共筛选出10个与GPI高度相关基因,分别为PKM、TPI1、PFKL、PKLR、PGM1、PFKP、ENO3、PFKM、H6PD、TKT.GO分析及KEGG功能富集分析结果显示,GPI基因与其相关的10个基因在功能富集上与糖酵解、合成、分解、代谢等能量代谢过程高度相关.结论 AD患者外周血及海马组织GPI基因表达下调,随AD病情加重,其表达持续减少;GPI基因与其相关基因可能参与AD患者海马脑区能量代谢的功能调控.
关键词：阿尔茨海默病磷酸葡萄糖异构酶生物信息学分析能量代谢
分类号：R742(神经病学与精神病学)
资助基金：国家自然科学基金(81501098)国家自然科学基金(81703519)国家自然科学基金(81803751)重大新药创制"科技重大专项(2018ZX09711001-008-006)沈阳市科技创新双百工程项目(100040)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 1-4 )
英文信息