生物钟基因在腹部恶性肿瘤组织中的表达差异
邱梦君1
熊枝繁1
何晓晓1
毕柠瑞2
汪朦朦1
杨盛力3
1.华中科技大学同济医学院附属梨园医院,武汉,4300772.贵州医科大学附属医院,武汉,4300773.华中科技大学同济医学院附属协和医院,武汉,430077
摘要：目的 探讨生物钟基因在腹部恶性肿瘤组织中的表达差异.方法 利用癌症基因组图谱数据库对14个生物钟基因(Per1、Per2、Per3、Cry1、Cry2、Timeless、CLOCK、BMAL1、NPAS2、NR1D1、NR1D2、DEC1、DEC2和RO-RA)的RNA-Seq在6种腹部恶性肿瘤(肝癌、胃癌、胰腺癌、肾癌、直肠癌、结肠癌)组织及邻近正常组织中的表达进行分析,用Bioconductor的edgeR去标准化RNA-Seq数据.结果 14个生物钟基因在6种腹部恶性肿瘤组织中均低表达.与邻近正常组织比较,肝癌组织Cry2、CLOCK、Timeless、NPAS2、NR1D1、DEC1、DEC2、RORA基因低表达(P均＜0.05),肾癌组织Per1、Per2、Cry1、Cry2、CLOCK、Timeless、NPAS2、NR1D1、NR1D2、DEC2、RORA基因低表达(P均＜0.05),结肠癌组织Per1、Per2、Per3、Cry1、Cry2、Timeless、BMAL1、NR1D2、DEC1、DEC2、RORA基因低表达(P均＜0.05),直肠癌组织Per1、Per3、Cry1、Cry2、CLOCK、BMAL1、NPAS2、NR1D1、DEC2、RORA基因低表达(P均＜0.05),胃癌组织Per1、Per3、Cry2、CLOCK、Timeless、BMAL1、NPAS2基因低表达(P均＜0.05).结论 生物钟基因在腹部恶性肿瘤组织中低表达,并且在不同类型腹部恶性肿瘤组织中表达亦存在一定差异.
关键词：腹部恶性肿瘤生物钟基因昼夜节律癌症基因组图谱数据库
分类号：R73(肿瘤学)
资助基金：国家自然科学基金(81702885)湖北省自然科学基金(2017CFB178)中央高校基本科研业务费专项(0118530328)中国肝炎防治基金会项目(TQGB20170005)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 13-16 )
英文信息