基于生物信息学分析结合RT-PCR检测的肝细胞癌组织中miRNA表达变化及意义
冯青青
赵文文
赵文飞
于文静
闫文娴
魏红梅
1.青岛市中心医院,山东青岛2660002.青岛市中心医院,山东青岛2660003.青岛市中心医院,山东青岛2660004.青岛市中心医院,山东青岛2660005.青岛市中心医院,山东青岛2660006.青岛市中心医院,山东青岛266000
摘要：目的 探讨基于生物信息学分析结合RT-PCR检测的肝细胞癌(HCC)组织中微小RNA(miRNA)表达变化及意义.方法 检索癌症基因组图谱(TCGA)数据库、高通量基因表达数据库(GEO)中HCC相关数据集,检索时间截至2018年2月,用生物信息学分析肿瘤组织与正常组织之间miRNA的表达差异,在GEO芯片集的HCC组织中验证差异表达的miRNA.用RT-PCR检测76例份HCC及癌旁组织中hsa-miR-191-5p、hsa-miR-221-5p表达,并分析二者表达与患者临床病理特征的关系.结果 在GSE12717筛选出43个差异表达miRNA(P<0.05,|Fold change|≥1),GSE10694筛选出50个差异表达miRNA(P<0.05,|Fold change|≥0.5),在TCGA中筛选出101个差异表达miRNA(P<0.05,|Fold change|≥1).hsa-miR-221-5p、hsa-miR-191-5p在两个GEO数据集中呈现差异表达,但在TCGA中未检测出二者表达差异.HCC及其癌旁组织中hsa-miR-191-5p相对表达量分别为6.03±1.82、0.93±0.08,hsa-miR-221-5p相对表达量分别为6.03±1.82、0.93±0.08.HCC组织中hsa-miR-191-5p、hsa-miR-221-5p表达均高于癌旁组织(P均<0.05).hsa-miR-191-5p表达与HCC的TNM分期、转移复发有关(P均<0.05),hsa-miR-221-5p表达与HCC的TNM分期、转移复发、包膜浸润有关(P均<0.05);二者表达与患者其他临床病理特征无关(P均>0.05).结论 基于生物信息学分析结合RT-PCR检测的HCC组织中hsa-miR-191、hsa-miR-221呈高表达,二者可能参与HCC的恶性进展.
关键词：肝细胞癌微小RNA生物信息学逆转录聚合酶链反应
分类号：R735.7(消化系肿瘤)
资助基金：Csco抗肿瘤血管靶向治疗科研基金资助项目(Y-S2014-016)
论文发表日期：2020-01-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 5-8,16 )
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