类风湿关节炎差异表达基因筛选、生物信息学分析及其潜在治疗药物的预测
孙胜南1
廖苑君1
蓝树金1
李让1
赵小蕾2
覃继恒2
饶绍奇1
1.广东医科大学医学系统生物学研究所,广东东莞523808;广东医科大学公共卫生学院2.广东医科大学医学系统生物学研究所,广东东莞523808
摘要：目的 筛选类风湿关节炎(RA)差异表达基因,对差异表达基因进行生物信息学分析,并预测潜在的RA治疗药物.方法 采用GEO2R在线工具软件分析RA数据集GSE97779和GSE1919,获得RA差异表达基因.通过String数据库构建RA差异表达基因蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape软件cytoHubba插件筛选出核心基因,并进行差异表达基因功能富集分析、通路富集分析和RA潜在治疗药物的预测.结果 共筛选出了100个RA差异表达基因,其中上调基因77个,下调基因23个;最终得到具有81个节点、383条边的PPI网络;GO和KEGG富集分析显示差异表达基因主要富集于免疫反应、质膜外侧面、CXCR3趋化因子受体结合和细胞因子-细胞因子受体相互作用通路.在药物基因相互作用数据库中发现了3个潜在治疗药物,分别是马拉维克、阿利法西普、艾地氯喹.结论 RA样本中共有100个差异表达基因;差异表达基因主要富集于细胞因子活性、G蛋白偶联受体结合、细胞因子-细胞因子受体相互作用和趋化因子信号通路等;马拉维克、阿利法西普、艾地氯喹是RA潜在的治疗药物.
关键词：类风湿关节炎差异表达基因生物信息学分析马拉维克阿利法西普艾地氯喹
分类号：R684.3(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)
资助基金：国家自然科学基金(81373085)
论文发表日期：2020-04-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 19-23 )
英文信息