环境化学物暴露对妊娠期糖尿病生物信息学的影响
刘素琴1
崔静2
孙健平2
隋树淼3
1.青岛市妇女儿童医院,山东青岛2660112.青岛市疾病预防控制中心 青岛市预防医学研究院3.莱西市院上中心卫生院
摘要:目的 探讨妊娠期糖尿病(GDM)共同关联基因参与的富集进程及信号通路并进一步研究影响GDM的环境化学物质.方法 从GEO数据库中获取GDM关联的基因,通过比较毒理基因组学数据库获取直接作用的GDM相关基因及化学物质,并筛选出二者共同的GDM关联基因.采用DAVID在线软件对GDM关联的基因进行基因本体论(GO)分析和BIOCARTA信号通路分析,采用String在线软件和Cytoscape软件对GDM关联的基因进行蛋白互作网络分析.结果 共发现有59个与GDM关联的基因.GO分析显示与GDM关联的基因主要集中在细胞外基质组织、血管再生、胚胎肢体形态发育、单生物细胞-细胞黏附以及细胞外区域等;BIOCARTA信号通路富集分析显示GDM共同的关联基因主要参与了IL-10抗炎信号通路、Ghrelin信号通路.蛋白互作网络分析显示GDM共同的关联蛋白共有6个模块,影响各个模块的环境化学物质主要为砷、莠去津、镉、二嗪农、二甲双胍、农药等.结论 环境化学物质能在基因/蛋白水平上影响GDM的发生发展.
关键词:妊娠期糖尿病环境化学物基因本体论BIOCARTA分析蛋白互作网络
分类号:R714.25(产科学)
资助基金:青岛市科技局立项项目(19-6-1-5-nsh)青岛糖尿病预防项目(WDF05-108)青岛糖尿病预防项目(WDF07-308)青岛市医药科研指导计划(2017-WJZD129)青岛市医药科研指导计划(2017-WJZD134)
论文发表日期:2021-05-05
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 56-58,62 )
