溃疡性结肠炎的关键致病基因及治疗中药活性成分筛选
刘涛1
陈新怡1
朱晓彤2
杨焘2
陈小娟1
仇婧玥1
刘恒铭2
冯瑶2
宋厚盼1
1.湖南中医药大学中医学院,长沙4102082.湖南中医药大学医学院
摘要：目的 运用生物信息学方法分析与溃疡性结肠炎(UC)发病的关键致病基因,筛选可能用于靶向治疗UC的中药活性成分.方法 从GEO数据库获取UC相关基因芯片数据集(GSE87466),纳入87例UC患者结肠黏膜组织标本(包括27例广泛性UC样本和60例局限性UC样本)和21例健康成人结肠黏膜组织标本,筛选UC患者及正常成人结肠黏膜组织显著性差异表达基因(DEGs),运用DAVID数据库对上述DEGs进行基因本体和信号通路富集分析,采用STRING及Cytoscape对与UC发病相关的DEGs进行蛋白质互作网络(PPI)分析UC核心致病基因.采用比较毒物基因组学数据库对UC致病核心基因与相关中药活性成分进行互联,得到可能用于治疗UC的中药活性成分.结果 与UC发病相关的核心基因包括白介素-8、基质金属蛋白酶9、表皮生长因子、白细胞介素1β、趋化因子2、趋化因子1、白细胞介素-10及白介素-2.可用于靶向治疗UC的中药成分包括白藜芦醇、槲皮素、姜黄素等.结论 与UC发病相关的DEGs有279个,核心基因有白细胞介素-8、基质金属蛋白酶9等8个;获得白细胞藜芦醇、槲皮素等46个可用于治疗UC的中药活性成分.
关键词：白介素-8基质金属蛋白酶9表皮生长因子炎症反应趋化因子白藜芦醇槲皮素溃疡性结肠炎
分类号：R587.2(内分泌腺疾病及代谢病)
资助基金：国家自然科学基金(81703920)湖南省自然科学基金(2019JJ50442)湖南省教育厅科学研究项目(19C1426)湖南中医药大学校级科研基金项目(2020XJJJ012)
论文发表日期：2021-06-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 33-38 )
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