与儿童哮喘发病相关的关键miRNA、mRNA筛选
邓坤1
易蔚1
赖海艳1
龙娟1
任梦瑶1
李伟伟2
1.广西中医药大学研究生院,广西南宁5300012.广西中医药大学第一附属医院儿科
摘要：目的 筛选与儿童哮喘发病相关的关键微小核糖核酸(miRNA)、信使核糖核酸(mRNA).方法 从高通量基因表达数据库(GEO)数据库获取哮喘儿童miRNA芯片数据集GSE25230,利用GEO2R筛选出差异表达miR?NA;对差异表达miRNA进行转录因子预测、下游靶基因预测;利用GEO数据库获取哮喘儿童mRNA芯片数据集GSE63142,同时使用GEO2R筛选出差异表达mRNA,并对差异表达mRNA进行KEGG、GO功能富集分析;将差异表达miRNA预测靶基因与差异表达mRNA取交集获得目标基因,最后构建哮喘儿童发病潜在miRNA-mRNA调控网络,进一步筛选出关键miRNA、mRNA.结果 共筛选出34个上调miRNA与35个下调miRNA,其转录因子主要有EGR1、SP1、SP4、RREB1、TFAP4.共筛选出68个上调差异表达mRNA与48个下调差异表达mRNA,KEGG富集结果显示差异表达mRNA主要涉及白介素17信号通路、神经活性配体—受体相互作用、趋化因子信号通路、肾素—血管紧张素系统等;GO功能富集分析显示,差异表达mRNA功能主要富集在细胞外基质、丝裂原激活蛋白激酶、细胞外间隙以及胞外区等生物学过程中.哮喘儿童发病潜在miRNA-mRNA网络Degree值排名前3的关键miRNA分别为hsa-miR-30c-5p、hsa-miR-181a-5p、hsa-miR-335-5p,关键mRNA分别为CXCL2、KIT、MUC5B.结论 筛选出与儿童哮喘发病相关的关键miRNA分别是hsa-miR-30c-5p、hsa-miR-181a-5p、hsa-miR-335-5p,关键mRNA分别是CX?CL2、KIT、MUC5B.
关键词：哮喘微小核糖核酸信使核糖核酸转录因子基因本体功能
分类号：R72(儿科学)
资助基金：国家自然科学基金(81860867)广西科技厅重点研发项目(AB18221030)硕士研究生科研创新项目(YCXJ2021037)
论文发表日期：2021-08-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 59-63 )
英文信息