基于生物信息学对NK细胞抑制肝细胞癌发生发展潜在关键基因的筛选和鉴定
赵文迪
田健
周建炜
河南大学人民医院肿瘤内科 河南省人民医院肿瘤中心,郑州450003
摘要：目的 基于生物信息学探讨和筛选自然杀伤(NK)细胞抑制肝细胞癌(HCC)发生发展过程中的关键基因及相关的信号通路.方法 在美国国立生物技术信息中心公共数据平台基因表达组学数据库(GEO)下载基因芯片数据GSE120123,从中选取4个关于NK细胞的样本,其中2个样本来自正常肝组织,2个来自HCC组织.分析其差异表达基因(DEGs),输入DAVID数据库进行基因本体学(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析,用Cyto-scape软件构建蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用STRING和Cytoscape进行模块分析,通过CytoHubba插件筛选关键基因.结果 共鉴定出317个DEGs(218个下调基因及99个上调基因).GO及KEGG分析结果表明,白细胞细胞黏附、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的负调控、细胞黏附分子、Rap1信号传导途径、细胞因子—细胞因子受体相互作用、趋化因子信号传导等信号途径参与到NK细胞抑制HCC的发生发展过程中.PPI网络由268个节点和242个边组成.最终选择出4个关键基因:CCR1、CCR5、CXCR6和CXCL12.结论 NK细胞抑制HCC发生发展过程中的潜在关键基因为CCR1、CCR5、CXCR6和CXCL12.
关键词：肝细胞癌自然杀伤细胞生物信息学关键基因信号通路
分类号：R735.7(消化系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(81673097)
论文发表日期：2021-10-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 1-4 )
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