基于生物信息学方法的沙眼衣原体主要外膜蛋白免疫优势表位预测及分析
李明洋1
徐远久1
鲁小龙1
张雷1
苏惠婷1
朱珊丽2
张友秀3
1.四川大学华西广安医院检验科,四川广安6380002.温州医科大学分子病毒与免疫研究所微生物学与免疫学教研室3.四川大学华西广安医院外围手术室
摘要：目的 预测和分析沙眼衣原体主要外膜蛋白(MOMP)的免疫优势表位.方法 以UniProt蛋白质数据库中检索Ct MOMP的氨基酸序列为基础,针对MOMP的理化性质、二级结构、亲水性参数、表面可及性参数、极性参数、抗原性和柔韧性参数,预测其B细胞表位;用SYFPEITHI、IEDB及Net CTI 1.2 server预测MOMP的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位;用RANKPEP及SYFPEITHI预测MOMP的辅助T细胞(Th)表位,筛选分值共同较高的多肽片段作为候选表位.应用Galaxy WEB对MOMP进行三维结构建模分析.结果 MOMP由393个氨基酸残基组成,以无规则卷曲及α螺旋为主;推测MOMP的B细胞表位位于N端42～52 aa、161～179 aa、259～265 aa和349～358 aa区段;其CTL表位主要集中于近C端,且以HLA-A*02:01、HLA-A*03限制性表位为主;Th表位各表型候选表位肽数目均较多.结论 沙眼衣原体MOMP含有潜在的B细胞和T细胞抗原表位,其免疫优势表位主要位于N端42～65 aa、155～185 aa区段和C端342～359 aa区段.
关键词：沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原表位生物信息学
分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
资助基金：国家自然科学基金(31700160)温州市科技局资助项目(Y20170011)
论文发表日期：2022-07-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 24-29 )
英文信息