基于TCGA数据库胶质母细胞瘤患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型构建
裴珍珍
王革生
宋光荣
蔡旭
杜勇
东潇博
北京中医药大学东方医院神经外科,北京100078
摘要：目的 构建基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库胶质母细胞瘤(GBM)患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型.方法 通过TCGA数据库获取GBM的高通量测序数据,通过文献检索和搜查FerrDb数据库两种方式获取铁死亡基因,并基于GBM中铁死亡相关差异表达的lncRNA构建GBM预后的多lncRNA模型,分析预后lncRNA与铁死亡基因的共表达关系.结果 共获得与GBM相关的铁死亡基因246个,铁死亡相关lncRNA 2624个,经差异分析和降维处理,最终得到102个与GBM显著相关的铁死亡基因,并构建了一个包含111个lncRNA的GBM预后模型,其中,69个差异有统计学意义的铁死亡基因与73个GBM预后相关的铁死亡lncRNA之间存在共表达关系.Kaplan-Meier生存曲线显示,在预后模型下,高危者和低危者的总生存率差异有统计学意义(P<0.01).结论 基于TCGA数据库成功构建GBM患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型,该模型可在一定程度上预测GBM患者的生存率.
关键词：胶质母细胞瘤铁死亡长链非编码RNA生物信息学TCGA
分类号：R739.41(神经系肿瘤)
论文发表日期：2022-12-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 64-67 )