MAGEA4和MAGEC1基因在肝细胞癌组织中表达变化及潜在转录调控机制的生物信息学分析
梁子谦1
黄李浩赟1
孙浩嘉1
吴晓娜1
苏颜雄1
贺菽嘉2
1.广西医科大学临床医学系,南宁5300212.广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室;广西高校生物分子医学研究重点实验室
摘要：目的 基于生物信息学方法观察MAGEA4和MAGEC1在肝细胞癌(HCC)组织中的表达水平,分析其对患者预后的影响,及其潜在的转录调控机制.方法 从TCGA和GEO数据库收集HCC高通量数据集TCGA-LIHC、GSE10143、GSE20140、GSE87630和GSE107170,比较MAGEA4和MAGEC1在HCC组织与癌旁肝组织中表达的差异.采用Pearson相关法分析MAGEA4和MAGEC1在HCC组织中表达的相关性.绘制受试者工作特征(ROC)曲线,以中位数区分MAGEA4和MAGEC1的高表达和低表达,依据曲线下面积(AUC)评估MAGEA4和MAGEC1表达区分HCC和癌旁正常肝组织的能力.采用Kaplan-Meier法分析MAGEA4和MAGEC1在HCC中的预后意义;通过ENCORI和Cistrome DB预测调控MAGEA4和MAGEC1表达的转录因子和miRNA.结果 在纳入的5个数据集中,MAGEA4和MAGEC1在HCC组织中的表达水平均高于癌旁正常肝组织(P均<0.05).在TCGA-LIHC、GSE10143、GSE107170数据集中,MAGEA4与MAGEC1在HCC组织中的表达均呈正相关(r分别为0.322、0.299、0.482,P均<0.01).MAGEA4区分HCC和癌旁正常肝组织具有轻到中度准确性,MAGEC1区分HCC和癌旁正常肝组织具有轻到高度准确性.在HCC组织中,MAGEA4与MAGEC1表达呈正相关(r=0.306,P<0.01).MAGEA4高表达与HCC患者的不良预后相关.与MAGEA4和MAGEC1均具有靶向关系的miRNA为hsa-miR-1827,与MAGEA4、MAGEC1具有潜在调控关系的转录因子为MYC和TFAP2A.结论 MAGEA4和MAGEC1在HCC组织中表达升高,且MAGEA4高表达是HCC预后的危险因素;hsa-miR-1827及转录因子MYC、TFAP2A可能共同参与调控MAGEA4和MAGEC1的表达.
关键词：肝细胞癌黑素瘤相关抗原靶向调控基因
分类号：R735.7(消化系肿瘤)
资助基金：国家级大学生创新创业训练计划项目(202010598029)广西一流学科(基础医学)建设项目(GXFCDP-BMS-2018)
论文发表日期：2023-01-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 16-19 )
英文信息