温阳解毒方治疗结直肠癌的核心靶基因筛选及其机制分析
陈伊伦1
钱力汇1
李文迪1
孙磊涛2
丁书凝1
1.浙江中医药大学第一临床医学院,杭州 3100532.浙江中医药大学附属第一医院 浙江省中医院肿瘤科
摘要:目的 利用网络药理学及分子对接技术筛选温阳解毒方治疗结直肠癌的核心靶基因,并探讨其可能的作用机制.方法 通过TCMSP、Uniprot数据库检索温阳解毒方6种中药的有效成分及相关靶基因,经Genecards数据库筛选得到结直肠癌相关疾病靶基因,二者取交集后得到温阳解毒方治疗结直肠癌的潜在靶基因.基于STRING数据库、Cytoscape软件绘制蛋白质互相作用网络(PPI)图并进行拓扑学分析,得到温阳解毒方治疗结直肠癌的核心靶基因.对核心靶基因进行基因本体(GO)功能、KEGG通路富集分析,采用分子对接技术对6种中药重复的关键活性成分和核心靶基因进行结构验证.结果 温阳解毒方6种中药的相关靶基因269个,与1 349个结直肠癌相关疾病靶基因取交集后,得到温阳解毒方治疗结直肠癌的潜在靶基因131个.PPI图的拓扑学分析结果显示,温阳解毒方治疗结直肠癌的核心靶基因有6个,分别是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt1)、p53、表皮生长因子受体(EGFR)、JUN、雌激素受体1(ESR1)、肿瘤坏死因子(TNF).GO功能及KEEG富集分析结果显示,核心靶基因主要作用于综合肿瘤信号通路、细胞衰老信号通路、p53信号通路、TNF信号通路、PI3K/Akt信号通路等.分子对接结果显示,Akt1、TNF、EGFR与温阳解毒方6种中药的11种关键活性成分均有较低的结合能,其中TNF与甲基黄连碱、EGFR与β-谷甾醇是结合能最低的两组,结合能分别为-6.78、-6.56.结论 温阳解毒方治疗结直肠癌的核心靶基因有Akt1、p53、JUN、EGFR、ESR1、TNF,其机制可能与调控p53、TNF、PI3K/Akt等信号通路有关.
关键词:温阳解毒方结直肠癌网络药理学分子对接细胞增殖细胞凋亡PI3K/Akt信号通路
分类号:R735.3(消化系肿瘤)
资助基金:浙江省大学生科技创新活动计划项目(021R410003)浙江省医药卫生科技计划项目(2022RC215)浙江中医药大学科研项目(2021RCZXZK10)
论文发表日期:2024-04-15
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 31-35 )
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山东医药

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ISSN:1002-266X
年,卷(期):2024,64(11)
所属栏目:论著