阿托伐他汀钙对人脐静脉内皮细胞增殖迁移的影响观察、关键靶基因及其相关lncRNA筛选
刘达彬1
吴丽美2
刘雪辉2
伍绍国2
孙朝晖3
1.南方医科大学第一临床医学院,广州 510515;广州市第十二人民医院检验科2.广州市第十二人民医院检验科3.南方医科大学第一临床医学院,广州 510515;中国人民解放军南部战区总医院检验科
摘要:目的 观察阿托伐他汀钙对人脐静脉内皮细胞(HUVECs)细胞增殖及迁移的影响,筛选阿托伐他汀钙对HUVECs作用的关键基因和共相关长链非编码核糖核酸(lncRNA).方法 取对数生长期HUVECs细胞,分为一组、二组,一组、二组细胞分别加入5 μmol/L的阿托伐他汀钙及等量PBS培养 24 h.①阿托伐他汀钙对HUVECs细胞增殖及迁移的的影响观察.取两组细胞,使用流式细胞仪测算两组细胞周期、采用CCK-8法观察两组细胞增殖情况、采用划痕愈合实验观察两组细胞迁移情况.②阿托伐他汀钙对HUVECs作用的关键基因和共相关lncRNA筛选.取两组细胞,运用illumina平台检测两组细胞mRNA、lncRNA,使用R Studio软件中的limma包筛选|log2 Fold change|>1.5、校正P<0.05的差异表达mRNA和lncRNA,运用基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析法分析差异表达mRNA的生物学功能.通过STRING数据库分析差异表达mRNA的蛋白互作用,使用CytoNCA插件筛选介数中心性最高的前10位关键基因,筛选与关键基因 Pearson相关性系数>0.99的共表达lncRNA.采用实时荧光定量PCR(qPCR)法检测两组关键基因及其共表达lncRNA.结果 与二组相比,一组细胞周期GO/G1期比例高、细胞增殖抑制,培养24 h细胞迁移面积小(P均<0.05).与二组相比,一组细胞有1 510个差异表达mRNA、744个差异表达lncRNA;差异表达mRNA的生物学功能涉及294个GO集及27条KEGG通路;关键基因共10个,与其共表达的lncRNA有130个,包括AC017101.1、AC125257.1及AC004846.1等.与二组相比,一组细胞HSP90AA1、CDK4、CCND1、PLK1、PCNA相对表达量降低,AC017101.1、AC125257.1、AC004846.1、AL390719.1相对表达量升高(P均<0.05).结论 阿托伐他汀钙能阻滞HUVECs的细胞周期于GO/G1期、抑制细胞的增殖和迁移.阿托伐他汀钙对HUVECs作用的关键基因有HSP90AA1、CDK4 及CCND1 等 10 个,共相关lncRNA有AC017101.1、AC125257.1及AC004846.1等130个.阿托伐他汀钙可能通过促进AC017101.1、AC125257.1及AC004846.1等共相关lncRNA表达,下调HUVECs细胞中HSP90AA1、CDK4及CCND1等关键基因表达,阻滞HUVECs的细胞周期、抑制细胞增殖及迁移.
关键词:阿托伐他汀钙人脐静脉内皮细胞信使核糖核酸长链非编码核糖核酸动脉粥样硬化
分类号:R972.6(药品)
资助基金:广东省自然科学基金资助项目(2314050001102)广州市科技计划项目(2023;2023A03J0492)广州市卫生健康科技项目(20231A011060)
论文发表日期:2024-10-25
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 39-43 )
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