冠心病合并2型糖尿病患者冠状动脉周围脂肪组织关键差异表达基因筛选及分析
胡亚辉1
张林鑫2
陈盈2
栗岩2
邢艳3
1.新疆医科大学基础医学院,乌鲁木齐 8300112.新疆医科大学第一附属医院影像中心3.新疆医科大学基础医学院,乌鲁木齐 830011;新疆医科大学第一附属医院影像中心
摘要:目的 分析冠心病(CAD)合并2型糖尿病(T2DM)患者冠状动脉周围脂肪组织(PCAT)中的差异表达基因,筛选CAD合并T2DM的关键差异表达基因,并进行验证.方法 在GEO数据库官网选取芯片GSE64554、GSE120774、GSE16415、GSE71416信息,筛选在CAD、T2DM均呈差异表达的基因,进行功能注释和通路分析,获得CAD合并T2DM的关键差异表达基因.选择行心脏瓣膜置换术的患者、CAD患者和CAD合并T2DM患者各20例分别纳入对照组、CAD组和CAD+T2DM组,选择术中留取的PCAT,采用RT-qPCR法检测三组PCAT中的关键差异表达基因.结果 共得到CAD、T2DM患者PCAT中均呈差异表达基因54个,根据功能注释得到3个关键基因即人Ⅱ类主要组织相容性复合体DRβ1(HLA-DRβ1)、肿瘤蛋白53(TP53)、CC趋化因子受体9(CCR9).对照组、CAD组、CAD+T2DM组TP53基因相对表达量依次增高(P均<0.05).CAD组和CAD+T2DM组CCR9表达高于对照组(P均<0.05).CAD+T2DM组HLA-DRβ1表达高于对照组(P<0.05).结论 CAD合并T2DM患者PCAT中关键差异表达基因为HLA-DRβ1、TP53和CCR9,其中TP53基因在CAD合并T2DM患者PCAT中表达变化显著,可能有助于CAD合并T2DM的诊断.
关键词:冠心病2型糖尿病冠状动脉周围脂肪组织TP53基因HLA-DRβ1基因CCR9基因生物信息学分析
分类号:R541.4(心脏、血管(循环系)疾病)
资助基金:国家自然科学基金(82160334)省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室(SKL-HIDCA-2023-10)天山英才医药卫生高层次人才培养项目(TSYC202301B009)
论文发表日期:2024-11-15
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 11-15 )
英文信息
