非酒精性脂肪性肝炎代谢相关关键差异表达基因靶向治疗药物的筛选与验证
黄雨晴
王小宁
陆景坤
内蒙古医科大学基础医学院,呼和浩特 010010
摘要：目的 筛选非酒精性脂肪性肝炎(NASH)代谢相关关键差异表达基因的靶向治疗药物,并进行验证,为NASH的新药研发提供参考.方法 从基因表达数据库(GEO)中下载NASH基因表达谱GSE164760和GSE63067数据集,利用R软件筛选差异表达基因(DEGs),并进行GO分子功能与KEGG信号通路分析.将NASH DEGs与代谢相关基因取交集,采用LASSO回归模型和SVM-RFE算法筛选NASH代谢相关关键DEGs.利用比较毒物基因组学数据库(CTD)、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Pubmed数据库筛选NASH代谢相关关键差异表达基因的治疗药物.利用Autodock4软件将获得的治疗药物与NASH代谢相关关键DEGs进行分子对接验证靶向关系.采用油红〇实验观察NASH代谢相关关键差异表达基因靶向治疗药物柚皮素对NASH细胞内脂滴含量的影响观察,采用实时荧光定量RT-qPCR法观察NASH代谢相关关键差异表达基因靶向治疗药物柚皮素对NASH细胞内NASH代谢相关关键DEGs的影响.结果 筛选得到336个DEGs,主要参与脂肪酸代谢过程、蛋白质导向和小分子分解代谢过程和辅助因子的生物合成、胆汁分泌和过氧物酶体等信号通路.NASH代谢相关关键DEGs为SLCO1B1、SCD、ACAT1基因.共同靶向ACAT1、SCD、SLCO1B1的化合物有4种,分别为柚皮素、环孢霉素、红豆碱、鹅去氧胆酸.分子对接验证结果显示,柚皮素、环孢霉素、红豆碱、鹅去氧胆酸与ACAT1、SCD、SLCO1B1基因之间具有较好的分子结合活性,具有靶向关系.细胞实验验证结果显示,靶向治疗药物柚皮素可降低NASH细胞内脂滴含量,影响NASH细胞内ACAT1、SCD、SLCO1B1基因表达.结论 筛选获得的NASH代谢相关关键差异表达基因靶向治疗药物是柚皮素、环孢霉素、红豆碱、鹅去氧胆酸,分子对接验证和细胞实验均验证通过.
关键词：慢性肝病非酒精性脂肪性肝病非酒精性脂肪性肝炎柚皮素靶向治疗药物
分类号：R96(药理学)
资助基金：国家自然科学基金(81960757)国家自然科学基金(82260813)内蒙古自治区成果转化项目(2019CG042)内蒙古自治区自然科学基金项目(2019MS08119)内蒙古自治区自然科学基金项目(2020MS08045)内蒙古医科大学基础项目(YKD2021MS033)内蒙古自治区科技计划项目(2023YFDZ0059)
论文发表日期：2024-11-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 25-29 )
英文信息