基于生物信息学方法筛选重度抑郁症关键基因及潜在治疗药物预测
王相文1
王圣海2
孙辰辉3
曲春晖3
孙平4
1.272000 济宁医学院精神卫生学院2.266034 青岛市精神卫生中心科教科3.266034 青岛市精神卫生中心老年二科4.266034 青岛市精神卫生中心老年二科;200030 上海交通大学医学院附属精神卫生中心临床研究中心
摘要：目的 通过生物信息学方法筛选重度抑郁症关键基因及潜在治疗药物.方法 收集GEO公共数据库中GSE98793、GSE76826数据集作为数据来源,采用在线工具及R语言进行数据分析、差异表达基因筛选和富集分析.蛋白质-蛋白质互作网络分析采用STRING数据库进行.关键基因的筛选采用Cytoscape软件.采用受试者工作特征(ROC)曲线评价诊断价值,采用Connectivity Map数据库预测治疗重度抑郁症的小分子药物.结果 筛选出TLR2、CD28、IL7R、IRF4、MAPK14共5个关键基因.ROC曲线结果显示,5个关键基因在GSE98793、GSE76826数据集中的ROC曲线下面积为0.616～0.804.预测得到UBP-302、ketanserin、CS-1657、androstenol、taurocholic-acid共5种小分子药物可能对改善重度抑郁症患者症状有潜在价值.结论 TLR2、CD28、IL7R、IRF4、MAPK14可能是重度抑郁症患者发病的关键基因,UBP-302、ketanserin、CS-1657、androstenol、taurocholic-acid 5个小分子化合物可能对于抑郁症状改善有一定效果,可为后续药物研究提供思路.
关键词：生物信息学抑郁症差异基因
资助基金：山东省医药卫生科技发展计划(2017WS748)
论文发表日期：2023-06-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 400-407 )
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