THBS1在胶质母细胞瘤中的表达及功能研究
胡慧敏1
李泽生2
刘博涵1
陈彦坤1
彭大钊1
1.100070 北京市神经外科研究所 首都医科大学附属北京天坛医院分子神经病理室2.300052 天津医科大学总医院 天津市神经病学研究所 教育部中枢神经损伤与再生重点实验室 天津市神经损伤变异与再生重点实验室
摘要：目的 研究THBS1在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达水平及功能.方法 在癌症基因组图谱计划(TCGA)和中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)_693、CGGA_325和CGGA_301数据集中提取数据,对基因表达数据进行标准化处理后,分析THBS1在低级别胶质瘤和GBM中的表达差异以及与异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变、1p/19q共缺失状态和生存预后的关系.基于单细胞测序数据、空间转录组数据,分析THBS1在胶质瘤组织中的主要分布.采用CellCall算法和MAGIC算法进一步分析THBS1在细胞相互作用网络之中的功能和THBS1相关基因及其功能,采用CIBERSORTx算法分析THBS1与免疫细胞浸润的关系.结果 THBS1在GBM组织中的表达水平高于正常组织,差异有统计学意义(P＜0.05).在CGGA和TCGA数据集中,THBS1在GBM患者中的表达水平高于低级别胶质瘤,差异有统计学意义(P＜0.01);THBS1在IDH野生型和非1p/19q共缺失型患者中的表达水平分别高于IDH突变型和1p/19q共缺失型,差异均有统计学意义(均P＜0.01).在CGGA_693和CGGA_325数据集中,THBS1基因高表达患者的生存率低于低表达患者,差异有统计学意义(P＜0.01).单细胞测序数据分析显示,THBS1主要在胶质瘤组织的单核/巨噬细胞中表达.空间转录组数据分析显示,表达THBS1的单核/巨噬细胞在空间方面与星形胶质细胞、肿瘤细胞、神经元、少突细胞、少突胶质细胞前体细胞存在共定位.THBS1阴性的单核/巨噬细胞和THBS1阳性的单核/巨噬细胞与肿瘤细胞、神经元之间细胞通信的通路活性及所依赖的配体-受体途径不同.功能富集分析显示,THBS1相关基因参与囊泡介导的转运、自噬、DNA结合转录因子活性的调节等生物过程.在4个数据集中,THBS1高表达组的巨噬细胞M0丰度高于低表达组,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 THBS1在GBM中高表达,与患者较差的预后相关;THBS1调控巨噬细胞M0浸润,表达THBS1的单核/巨噬细胞可能调控GBM的微环境,进而调控肿瘤发生.
关键词：胶质瘤胶质母细胞瘤预后THBS1细胞通讯
论文发表日期：2024-05-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 319-327 )
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