PGM2在脑胶质瘤中的表达及临床意义
沈若菲
蒋传路
蔡金全
150001 哈尔滨医科大学附属第二医院神经外科
摘要:目的 探讨磷酸葡糖变位酶2(PGM2)在脑胶质瘤中的表达及临床意义.方法 提取中国胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库中脑胶质瘤患者的临床数据和mRNA测序数据,将测序数据与临床数据相匹配后提取PGM2基因的表达情况,并剔除临床数据缺失的病例.根据受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线获得的临界值(Cut-off值)将病例分为PGM2高表达组和PGM2低表达组.采用ROC曲线下面积(AUC)和Kaplan-Meier生存曲线评价PGM2表达水平对胶质瘤患者总生存率的预测价值.采用单因素分析影响PGM2表达水平的胶质瘤临床病理因素.采用单因素、多因素Cox回归分析脑胶质瘤相关临床病理因素和PGM2表达与胶质瘤患者预后的关系.通过筛选共表达基因,进行基因本体(GO)富集分析和KEGG通路分析,探讨PGM2参与生物学过程以及调控的相关信号通路.采用CIBERSORT算法分析胶质瘤PGM2表达与免疫细胞浸润的关系.结果 CGGA-325数据库剔除缺失值后余273例,TCGA数据库剔除缺失值后余560例.PGM2表达量预测胶质瘤患者总生存率的ROC曲线分析显示,其在CGGA-325数据库中的AUC为0.705(95%CI:0.640~0.769),Cut-off值为10.1;在TCGA数据库中的AUC为0.739(95%CI:0.699~0.778),Cut-off值为8.9.根据Cut-off值将病例分为PGM2高表达组和PGM2低表达组.Kaplan-Meier生存分析显示,PGM2高表达组患者的总生存率较PGM2低表达组患者下降,差异有统计学意义(P<0.001).CGGA-325和TCGA数据库中,PGM2低表达与高表达组的胶质瘤级别、IDH分型以及1p/19q缺失情况比较,差异均有统计学意义(均P<0.05).多因素Cox回归分析显示,CGGA-325数据库与TCGA数据库中胶质瘤共同独立预后因素是胶质瘤级别与1P/19q共缺失,PGM2表达在CGGA-325数据库中显示为独立预后因素(均P<0.05).GO富集分析和KEGG通路分析显示,PGM2表达与内质网蛋白转运、Toll样受体信号通路以及I-κB激酶/NF-κB信号通路相关.CIBERSORT分析显示,PGM2低表达组与高表达组的初始CD4+T细胞、活化的记忆CD4+T细胞、调节性T细胞、单核细胞、巨噬细胞(M0、M1、M2)、中性粒细胞等的免疫浸润程度比较,差异均有统计学意义(均P<0.05).结论 PGM2的高表达与胶质瘤较差的预后相关,可能作为判断胶质瘤患者预后的指标,未来有望成为胶质瘤潜在的治疗靶点.
关键词:胶质瘤PGM2分子病理预后
论文发表日期:2024-05-20
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 348-356 )
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神经疾病与精神卫生

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ISSN:1009-6574
年,卷(期):2024,24(5)
所属栏目:脑胶质瘤分子病理研究专题