PVRL2基因在胶质瘤中的表达及其与临床和免疫特征的相关性分析
杨坤1
白丽2
1.671000 大理大学基础医学院2.671000 大理,云南省昆虫生物医药研发重点实验室
摘要:目的 探究脊髓灰质炎病毒受体相关蛋白2(PVRL2)基因表达与胶质瘤的预后、免疫浸润和分子特征的关系.方法 利用UCSC数据集分析PVRL2基因表达差异,整合癌症基因组图谱(TCGA)数据库中656例胶质瘤(GBMLGG)患者的基因组和临床数据,研究PVRL2表达与临床分级的关系.通过R包maxstat确定最佳截断值,将样本分为高、低表达组,使用Kaplan-Meier生存曲线和log-rank检验评估生存差异并进行Cox单因素回归分析.采用Pearson相关性分析PVRL2表达与肿瘤干性评分的相关性.分析共表达基因、基因本体(GO)功能和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集,构建PPI网络.分析PVRL2与免疫细胞浸润及免疫调节基因的相关性.结果 PVRL2在25种肿瘤中上调,5种肿瘤中下调,GBMLGG中显著上调(P<0.05).PVRL2在高级别胶质瘤的表达值(4.78±0.72)高于低级别胶质瘤(4.41±0.51)(P<0.001).计算出最佳截断值为5.190 7,根据截断值将患者分成高、低表达组,Kaplan-Meier生存分析显示在总胶质瘤患者及低级别、高级别胶质瘤患者中高表达组生存期均短于低表达组,风险比均大于1,PVRL2表达与死亡风险和疾病进展呈正相关(P<0.05).PVRL2与基于DNA甲基化、差异甲基化、表观遗传学调控的DNA甲基化和增强子的DNA甲基化的干性评分呈正相关(均P<0.001).PVRL2与20 118个基因共表达,富集分析显示其与细胞外基质、病毒感染、免疫调控、血管生成等功能和通路相关,且与免疫调节性分子高度相关(FDR<0.05).PVRL2表达与多种免疫细胞浸润和多数免疫调节基因相关(P<0.05).结论 PVRL2高表达与胶质瘤临床分级和预后不良相关,并与免疫调节密切相关.
关键词:胶质瘤PVLR2生物信息学免疫调节免疫细胞浸润预后
论文发表日期:2025-06-20
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 416-425 )
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