德宏奶水牛TLR8基因乳腺组织表达及生物信息学分析
唐娜1
王梦迪1
彭虹菱1
张永云2
霍金龙3
杨忠4
李卫真1
1.云南农业大学动物医学院,云南昆明6502012.云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心,云南昆明6502013.云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明6502014.云南生物制药有限公司,云南昆明650503
摘要：试验研究不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织中TLR8基因的表达规律及水牛TLR8的结构.利用乳品分析仪测定乳脂率,以7％～8％为中乳脂率组(M组),高于8％为高乳脂率组(H组),低于7％为低乳脂率组(L组).采用实时荧光定量PCR技术检测TLR8基因表达量,与乳脂率进行相关性分析,利用生物信息学方法分析水牛TLR8的结构特征.结果 表明,L组TLR8基因的表达量极显著高于H组和M组(P＜0.01).TLR8基因mRNA的表达水平与乳脂率呈显著负相关(P＜0.05).TLR8分子式为C5338H8275N1399O1567S31,分子质量为118 kD,理论等电点为5.90,亲水性总平均值为-0.134.TLR8属于跨膜蛋白,具有信号肽序列MTLRFLLLTSLFLLISDS,第18～19位氨基酸之间存在切割位点.TLR8的胞外区含有12个LRR、3个LRR_TYP和1个LRR_CT,胞内区具有1个TIR结构域.二级结构以α螺旋为主.TLR8主要与MyD88、IRAK1、IRAK4等蛋白相互作用.研究表明,水牛TLR8结构与TLR家族相似,且德宏奶水牛乳腺组织TLR8基因的表达量随着乳脂率增加呈下降趋势.
关键词：德宏奶水牛TLR8基因基因表达生物信息学
分类号：S823.8+3(家畜)
资助基金：国家自然科学基金(31460649)云南农业大学兽医公共卫生省创新团队项目(202105AE160014)云南省专家工作站项目(202005AF150041)云南农业大学科技创新创业行动基金项目(2021ZKX056)云南农业大学科技创新创业行动基金项目(2021ZKY097)
论文发表日期：2021-09-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 69-72 )
英文信息