浑浊红球菌LPD06283蛋白的生物信息学分析
马学婧1
白静2
韩靖轩1
柏潇萌1
韩然1
李泊颖1
郝雅如1
张兆英1
1.沧州师范学院生命科学系,河北 沧州 0610012.沧州职业技术学院农牧工程系,河北 沧州 061001
摘要：试验旨在探究浑浊红球菌PD630(Rhodococcus opacus PD630)LPD06283蛋白的结构与功能.采用生物信息学方法对LPD06283蛋白的理化性质、亲水性、疏水性、双性α螺旋、同源性、信号肽、跨膜区、二级结构、结构域、三级结构、磷酸化修饰位点、相互作用蛋白质进行研究.结果显示,LPD06283蛋白是一种稳定酸性亲水蛋白,N端疏水区形成双性α螺旋,与红球菌RHA1(Rhodococcus jostii RHA1)MLDS蛋白的亲缘关系较近,无信号肽和跨膜区;LPD06283蛋白的二级结构由α螺旋(81.88％)、β转角(3.62％)和无规则卷曲(14.49％)构成,N端存在一个载脂蛋白结构域,三级结构采用综合法预测得到且质量较高;LPD06283蛋白含有19个磷酸化位点,相互作用最强的蛋白质是XRE家族DNA结合蛋白.研究表明,LPD06283蛋白可能参与浑浊红球菌的脂质代谢,可作为微生物油脂研发的潜在靶标.
关键词：LPD06283蛋白浑浊红球菌PD630微生物油脂蛋白结构生物信息学分析
分类号：S816(普通畜牧学)
资助基金：河北省教育厅科学技术研究项目(QN2020515)沧州师范学院校内科研基金项目(XNJJLQN2021002)沧州师范学院校内科研基金项目(XNJJL1907)
论文发表日期：2023-02-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 82-87 )
英文信息