基于GEO数据库的硒酵母影响肉鸡肝脏差异表达基因的生物信息学分析
张吉清
马秀亮
王桂英
聊城大学农学与农业工程学院,山东 聊城 252000
摘要：试验旨在筛选补充硒酵母后肉鸡肝脏的差异表达基因(DEGs),探究硒酵母影响肉鸡生长发育和健康的分子作用机理.研究从基因表达综合数据库(GEO)获取基因表达谱数据集,进行生物信息挖掘.结果显示,筛选出与硒酵母有关的600个DEGs,利用DAVID软件对其进行基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)注释,显著富集18个生物学过程和12个KEGG通路;利用STRING数据库构建546个节点和905个边的蛋白互作网络(PPI);利用Cytoscape软件筛选出6个枢纽基因(FN1、PLCG1、MYO3A、ITGA8、KDM6A和ATP2B2)和4个基因模块.研究表明,上述6个枢纽基因和心肌细胞中肾上腺素能信号、钙信号通路、同源重组、黏着斑及真核生物核糖体生物合成5个通路可能是硒酵母影响肉鸡生长发育和健康的关键基因和关键途径.
关键词：硒酵母GEO数据库肉鸡肝脏差异表达基因生物信息学分析
分类号：S816.7(普通畜牧学)
资助基金：聊城大学畜牧学学科开放课题基金项目(319312101-12)
论文发表日期：2023-12-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 84-89 )
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