27株关中黑猪肠道食淀粉乳杆菌基因组分析
萧犹睿1
郝泽华1
刘好静1
肖攀1
王松锐1
何伟先2
杨明明1
1.西北农林科技大学动物科技学院,陕西咸阳 7121002.四川省齐全饲料有限责任公司,四川遂宁 629000
摘要：研究从基因组水平解析27株关中黑猪肠道食淀粉乳杆菌的遗传背景和功能基因特征,采用Illumina测序技术完成27株食淀粉乳杆菌的全基因组测序、框架图组装,通过平均核苷酸一致性分析、系统进化分析、泛基因组分析等比较基因组学方法分析菌株间的同源性和分子进化规律,使用eggNOG、CAZy、ResFinder、VFDB等数据库注释功能基因.结果显示,27株食淀粉乳杆菌平均基因组序列大小为1 881 796 bp,平均GC含量为38.10％,菌株间具有高度同源性和遗传多样性.功能基因注释显示,这些菌株不仅具备良好的生存能力和安全性,还具有环境应激、氧化应激、核黄素合成、胞外多糖分泌和群体感应等潜在益生基因.研究表明,分离自关中黑猪肠道的27株食淀粉乳杆菌适合作为候选益生菌株.
关键词：食淀粉乳杆菌全基因组测序功能注释潜在益生基因
分类号：S816.7(普通畜牧学)
资助基金：四川省科技计划项目(2021ZHFP0036)
论文发表日期：2024-10-31
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 62-68 )
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