基于16S rRNA高通量测序技术分析梅花鹿瘤胃微生物多样性和功能预测的研究
曲磊
关诗宇
谷兴亮
秦立红
吉林省农业科学院 中国农业科技东北创新中心,吉林 长春 130033
摘要：试验旨在探究成年梅花鹿母鹿瘤胃内微生物的多样性及其功能预测,利用16S rRNA高通量测序技术分析瘤胃液样品菌群结构,利用PICRUSt2进行功能预测.结果显示,通过Illumina NovaSeq测序平台共获得289 424条优质序列,聚类分析共得到7 547条操作分类单元(OTU).Alpha多样性指数表明,梅花鹿瘤胃微生物群落丰富度(Chao1=1 510.99,Ace=1 520.92)及多样性(Simpson=0.99,Shannon=8.50)均较高.优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes,51.47%)、拟杆菌门(Bacteroidota,36.94%),优势菌目为拟杆菌目(Bacteroidales,36.91%)、毛螺菌目(Lachnospirales,15.32%)、颤螺旋菌目(Oscillospirales,10.54%),优势菌属为普雷沃氏菌属(Prevotella,10.78%)、未培养_瘤胃细菌属(uncultured_rumen_bacterium,9.27%)及理研菌科RC9 肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group,8.66%).KEGG数据库分析得到6类一级水平代谢通路,COG数据库分布在24个COG类别.功能类别主要集中在一般功能预测、氨基酸转运和代谢、翻译,核糖体结构和生物转化、转录、碳水化合物的运输和代谢.研究表明,梅花鹿瘤胃菌落具有明显的多样性,含有丰富的降解纤维素的微生物,试验结果可为挖掘梅花鹿瘤胃微生物功能基因提供参考.
关键词：梅花鹿瘤胃微生物16S rRNA功能预测
分类号：S825(家畜)
资助基金：吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)基本科研经费项目(KYJF2023XK102)吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)研究所创新基金(项目(CXGC2023SJ101)
论文发表日期：2025-03-16
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 102-106 )
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