0～6月龄皮山红羊肠道微生物群落多样性研究
比吉古丽·萨塔尔1
努尔阿卜杜拉·吾吉外力1
朱梦婷1
杨会国2
依明·苏来曼1
1.新疆农业大学动物科学学院,新疆乌鲁木齐 8300522.新疆畜牧科学院畜牧研究所,新疆乌鲁木齐 830011
摘要：试验旨在探究不同生长阶段的皮山红羊肠道微生物多样性的差异.选取初生体重相近的12只皮山红羊羔羊,分别于0、2和6月龄时追踪采集直肠粪便,共获得36个粪便样本.提取DNA后,利用宏基因组二代测序技术对羔羊直肠内容物进行微生物多样性分析.illumina测序共获得119 564 947.16条原始数据,平均原始数据39 854 982.39条,平均过滤后数据量为7 539 585 857.50 bp,Q20与Q30比率分别高于98.69％和96.06％.结果显示,过滤后的数据质量较好,可以用于后续分析.Alpha多样性结果表明,2月龄Shannon指数和Simpon指数与6月龄无显著差异(P＞0.05),但极显著高于0月龄(P＜0.01).2月龄和6月龄的Ace指数和Chao1指数极显著高于0月龄(P＜0.01).在门水平上,皮山红羊粪便中优势菌均为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和放线菌门.在属水平上,0月龄时以大肠杆菌属、葡萄球菌属和丁酸球菌属为主;2月龄时乳杆菌属、梭菌属和拟杆菌属的丰度较高;6月龄则以拟杆菌属、艾氏菌属和梭菌属为主.研究表明,随着月龄增长,皮山红羊肠道微生物多样性和丰度逐渐增加.
关键词：皮山红羊宏基因组肠道微生物多样性
分类号：S826(家畜)
资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金重点项目(2024D01D08)
论文发表日期：2025-10-28
在线出版日期：2025-12-29（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 91-96 )
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