小鼠舌癌模型差异基因的筛选及生物信息学分析
武媛1
万晓文2
王伟1
蒋琳1
邵益森1
何露露1
1.江西中医药大学附属医院,江西南昌,3300062.江西中医药大学,江西南昌,330004
摘要：目的:对小鼠舌癌模型差异表达基因进行筛选及基因功能分析,为舌癌发病机制相关的分子标志物及药物靶点提供理论基础.方法:从高通量基因表达(GEO)数据库中选取GSE64271和GSE75421数据包,获取其中小鼠舌癌模型的芯片数据,分为舌癌组和非舌癌组,利用R语言的limma包分析筛选差异基因.利用DAVID和STRING数据库对差异表达基因进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)基因功能分析、蛋白相互作用分析.结果:对差异基因筛选后,将两个数据集的数据取交集后最终得到303个基因,其中31个基因上调与细胞周期(Cell Cycle)和卵母细胞分裂有关,说明在肿瘤发生发展的过程中,通过上调这些基因促进肿瘤增殖.而其余基因的KEGG分析结果则表明这些基因与代谢过程密切相关.通过蛋白互作网络(PPI)筛选出cross-talk基因:整合素a1(Itga1)和整合素a6(Itga6).结论:筛选出的差异基因可能在舌癌的分子层面发挥了重要的作用,为舌癌发生、发展的机制、肿瘤标志物的筛选等提供了理论依据.
关键词：生物信息学分析差异表达基因舌癌
分类号：R782.2(口腔颌面部外科学)
资助基金：江西省教育厅科技项目(160805)江西省卫生厅项目(20185327)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 31-36 )
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