连接酶反应技术检测冠心病三个相关基因的单核苷酸多态性
缪应新
甘洁民
施泓
陈洁
周晓倩
赵虎
1.复旦大学附属华东医院检验科, 上海市,2000402.复旦大学附属华东医院检验科, 上海市,2000403.复旦大学附属华东医院检验科, 上海市,2000404.复旦大学附属华东医院检验科, 上海市,2000405.复旦大学附属华东医院检验科, 上海市,2000406.复旦大学附属华东医院检验科, 上海市,200040
摘要:目的 利用聚合酶链反应-连接酶反应(polymorphism chain reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)技术检测瘦素受体基因Lys109Arg (A/G)、Gln223Arg (A/G),脂联素基因G276T、T45G,护骨素基因T950C、G1181C六个多态性位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP).方法 参照待测多态性位点所在DNA序列设计并合成一对引物及3条探针,先通过PCR反应获得含有待检测突变位点的基因片段,再进行LDR,根据测序电泳结果所显示的含荧光标记的LDR产物的片段长度来判断基因型别.结果 采用PCR技术成功扩增出包含瘦素受体基因(110 bp,130 bp)、脂联素基因(400 bp)、护骨素基因(118 bp,163 bp)多态性位点的基因片段.根据LDR产物片段长度不同进行基因分型,纯合子只有一种片段长度,杂合子包含两种纯合子的片段长度,如瘦素受体基因SNP Lys109Arg (A/G)的PCR产物长度为110 bp,LDR产物片段的长度为110 bp时则判断为AA基因型,112 bp则判断为GG基因型,AG基因型则具有110 bp、112 bp两种片段长度.PCR-LDR基因分型结果与DNA测序技术的检测结果一致(Kappa=1,P=0.00).结论 PCR-LDR技术简单、快速、准确、成本低,适用于大批量SNP检测.
关键词:聚合酶链反应连接酶反应单核苷酸多态性瘦素受体基因脂联素基因护骨素基因
论文发表日期:2011-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 215-219 )
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