不同基因型戊型肝炎病毒株宿主选择性差异的基因突变分析
王晨
付红伟
杨桂芳
1.天津医科大学总医院医学检验科, 天津,3000522.天津医科大学总医院医学检验科, 天津,3000523.天津医科大学总医院医学检验科, 天津,300052
摘要：目的 初步探讨影响不同基因型戊型肝炎病毒(HEV)能否跨物种传播的核苷酸或氨基酸突变位点的特点.方法 从DNA序列GenBank数据库获得87株HEV全基因组序列,根据宿主选择不同的特点将其分为H类和Z类,其中H类为基因1型和2型,Z类为基因3型和4型.通过ALIGNX软件对两类中全部HEV全基因组序列进行比对分析,寻找影响两类HEV病毒株间宿主选择或致病性差异的可疑核苷酸或氨基酸突变位点.结果 本研究共发现26个可疑的核苷酸或氨基酸突变位点,可能参与决定不同基因型HEV宿主选择性差异;这些突变位点分布在ORF1区有16个,ORF2区有7个,ORF3区有1个,5'UTR和3'UTR区分别各有1个,特别是G11A/C(5'UTR区)、T511S(E2s蛋白决定簇区)及E78D(ORF3区)相对于其他突变子更为重要.结论 26个可疑特异性核苷酸或氨基酸突变位点的发现为研究不同基因型HEV宿主选择性和致病性差异提供了重要线索.
关键词：戊型肝炎病毒宿主核酸决定子
资助基金：国家自然科学基金(81401746)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 1-4 )
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