RNA甲基化修饰N6-甲基腺苷在黑色素瘤预后及免疫微环境中的作用
董政
谭谦
南京大学医学院附属鼓楼医院 整形烧伤科,江苏 南京 210008
摘要：目的 黑色素瘤中构建基于m6A甲基化调控因子的风险模型,以探究m6A甲基化调控因子在黑色素瘤中的预后和免疫治疗价值.方法 自2022年1—2月,南京大学医学院附属鼓楼医院整形烧伤科从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因型组织表达(genotype tissue expression,GTEx)数据库中收集470例黑色素瘤样本的基因表达数据和相应的临床信息以及1809例正常对照样本的序列数据.独立t检验分析20个m6A甲基化调控因子在肿瘤和正常组织的差异表达.一致性聚类分析基于m6A甲基化调控因子将黑色素瘤患者分为两个聚类,CIBERSORT分析比较两个聚类患者群体免疫浸润水平.通过Cox回归分析筛选与黑色素瘤预后显著相关的基因.Lasso回归分析用来构建在黑色素瘤中的风险预测模型.结果 黑色素瘤样本与正常样本在不同m6A甲基化调控因子间差异具有统计学意义,其中ZC3H13、YTHDF3、IGF2BP2、IGF2BP3在黑色素瘤中明显高表达(P<0.05).聚类分析和CIBERSORT分析显示,集群1与集群2存在免疫浸润差异.基于Lasso回归分析筛选出RBM15B和WTAP作为m6A相关的预后模型,高风险组患者生存期明显缩短(P=0.00179).多因素Cox回归分析显示,RBM15B是黑色素瘤预后的独立预测因素,结合CIBERSORT分析显示,RBM15B高表达与浸润性免疫细胞具有相关性.结论 m6A甲基化调控因子在黑色素瘤中可以提示免疫浸润情况.基于黑色素瘤中关键m6A甲基化调控因子所构建的预后风险模型具有较好的预测能力.RBM15B可能为黑色素瘤潜在风险因素和免疫浸润潜在相关m6A调控因子.这项研究为对m6A调控因子的表观遗传学理解和黑色素瘤的新治疗策略提供了新的见解.
关键词：黑色素瘤m6A甲基化调控因子RBM15B生物信息学分析
论文发表日期：2022-12-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 729-733,后插12-6 )
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