基于加权基因共表达网络分析识别雄激素性脱发的枢纽基因
候圣祥
张敬芳
胡俊
刘璐
陈天禹
庞燊
410219,长沙医学院
摘要：目的 使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究雄激素性脱发(AGA)基因的协同共表达,寻找与雄激素性脱发有关的关键基因.方法 借助R语言分析基因表达数据库(GEO)中关于AGA的GSE90594数据集,得到与临床表现正负相关性最高的模块各一个,并提取模块中的基因,使用clusterprofiler包进行下游GO与KEGG富集分析,同时对模块内GS和MM的相关性进行分析,并使用Cytosacpe绘制共表达网络图,筛选枢纽基因.结果 根据基因表达的相关性,发现20个共表达模块,其中brown模块和turquoise模块与AGA显著相关,共表达网络发现13个基因(PDGFRA、PMP22、ZCCHC24、COL6AI、ISLR、PRRX1、PKP1、CALN1、PNMAL2、PPP5D1、GJB6、DSC2、GJA3)在网络中处于核心的地位.并用上述基因做了疾病模型,对疾病预测准确性很高.结论 PDGFRA、PMP22、ZCCHC24、COL6A1、ISLR、PRRX1 的表达与 AGA 呈正相关,PKP1、CALN1、PNMAL2、PPP5D1、GJB6、DSC2、GJA3的表达与 AGA 呈负相关.
关键词：脱发雄激素性权重基因共表达网络分析生物信息学
分类号：R758.71(皮肤病学与性病学)
资助基金：国家级大学生创新创业训练计划项目(S202010823012)湖南省教学改革研究项目(HNJG-2020-1038)湖南省学位与研究生教育改革研究项目(2020JGYB271)湖南省教育科学十三五规划项目(XJK20CGD049)
论文发表日期：2022-02-10
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 9-13 )
英文信息