子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d1之间关系的生物信息学分析
欧阳穗1
黄于艺2
凌春芳2
何颖2
陈惠芳2
邹泽红2
1.510170,广州医学院荔湾医院2.501260,广州医学院第二附属医院/呼吸疾病国家重点实验室变态反应研究室、广州市过敏反应与临床免疫重点实验室
摘要:目的:分析人子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d 1之间关系.方法:运用ClustalW 1.83和MEGA 5.1 Beta3软件比较人分泌球蛋白家族序列及猫过敏原Fel d 1两个亚基P30438和P30440之间的进化树形图;采用在线软件平台NetMHCII 2.2比较分析P30438与子宫珠蛋白典型序列P11684之间抗原性差异;利用Swiss-Model程序模拟并比较P11684、P30438和P30440的三级结构.结果:分泌球蛋白家族充斥着大量冗余数据,经逐步聚类收缩至13个代表性序列进一步分析发现,整个分泌球蛋白家族划分成两个大家族三个亚家族,而子宫珠蛋白典型序列与猫主要过敏原Feld 1的一个亚基P30438之亲缘关系最近,两者均具有与HLA高亲和力结合位点,而且三级结构相似.结论:子宫珠蛋白具有潜在的过敏原性.
关键词:子宫珠蛋白猫主要过敏原Fel d 1进化树形图抗原性三级结构
资助基金:国家自然科学基金(30771240)国家科技重大专项(2011ZX08011-005)
论文发表日期:2013-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:3( 2248-2250 )
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