生物信息学辅助克隆和分析人GLUT-9基因启动子
林绍鹏
潘速跃
1.南方医科大学南方医院神经内科, 广州市,5105152.南方医科大学南方医院神经内科, 广州市,510515
摘要：目的:对人GLUT-9基因5'-非翻译区进行克隆,并对其启动子和转录调控区进行生物信息学分析,为后续的GLUT-9基因的转录调控研究奠定基础.方法:通过搜索网络数据库,得到GLUT-9基因翻译起始点上游约2 kb的序列.以人总DNA为模板,采用PCR方法进行序列克隆.运用BDGP:Neural NetworkPromoter Prediction软件对上述序列进行分析,预测出该段序列可能的启动子区域；运用TFSEARCH软件分析潜在的转录因子结合位点.结果:人GLUT-9基因的启动子可能位于转录起始点上游反义链的-550到-503区,序列上存在包括CdxA、SRY和Lyf-1等12个转录因子的潜在结合位点.结论:克隆得到人GLUT-9基因5'-非翻译区2 kb的序列,对人GLUT-9基因启动子和5'-非翻译区调控区序列进行了初步的生物信息学分析,为后续试验提供了研究基础.
关键词：生物信息学GLUT-9启动子转录调控
资助基金：广东省科技计划(2011B061300004)广东省自然科学基金(S2011010002975)
论文发表日期：2013-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 2961-2963 )
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