RACK1为核心的口腔鳞状细胞癌差异基因的荧光定量RT-PCR表达验证及相互关系分析
郑建伟1
杨淑娟2
丘洪添3
利小平3
韦从云3
李婷3
莫文娟3
蔡秋云3
罗刚1
1.510280,南方医科大学附属广东省口腔医院2.610041,四川大学华西公共卫生学院健康与社会行为学系3.518001,广东省深圳牙科医疗中心
摘要：目的：通过对实验组前期口腔鳞癌组织与癌旁正常对照组织基因芯片检测数据和前期蛋白组学实验筛选的52种差异蛋白进行综合分析，筛选出差异基因，通过荧光定量RT-PCR实验去验证这些差异基因在口腔鳞癌组织和癌旁正常对照组织中的表达。方法：（1）在前期实验组经典蛋白组学实验筛选出的52种差异蛋白中，我们综合口腔鳞癌的表达谱芯片检测结果，选择变化趋势相同且差异相对较大的基因。（2）收集广东省口腔医院等手术切除的口腔鳞癌及癌旁正常组织各32份，通过荧光定量RT-PCR进行较大样本的验证并分析这些差异基因的相互作用关系。结果：经过荧光定量RT-PCR验证后，GNB2L1、ARHGDIB、STMN1、LGALS7、EIF5A、TAGLN表达上调，差异具有统计学意义（P＜0．001）；S100A7、S100A8、S100A9、ANXA1、ANXA2、ANXA5、CSTB、CRYAB、SERPINB3表达下调，差异具有统计学意义（P＜0．001）。在STRING构建的作用网络中RACK1蛋白与其他差异基因发生关系最多。结论：荧光定量RT-PCR验证差异基因的变化趋势与基因表达谱芯片数据结果具有很好的一致性。 RACK1蛋白是口腔鳞癌的一个关键节点蛋白。
关键词：口腔鳞状细胞癌差异蛋白RACK1荧光定量RT鄄PCR
资助基金：广东省医学科学技术研究项目(A2011092)国家自然科学基金(81271159／H1405)
论文发表日期：2014-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 3925-3928 )