RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因预测
李秋兰
王顺清
张玉平
陈晓燕
谢健晋
吴亮亮
1.广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科, 广州市,5101802.广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科, 广州市,5101803.广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科, 广州市,5101804.广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科, 广州市,5101805.广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科, 广州市,5101806.广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科, 广州市,510180
摘要：目的 探讨RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因.方法 利用慢病毒介导的RNA干扰技术,建立多批次RYBP基因稳定沉默的HL60细胞株及空载体对照组(NC);通过二代测序技术对不同批次干扰的上述3对细胞进行mRNA测序及miRNA测序,利用KEGG等生物信息学分析方法,预测靶基因.结果 成功构建RYBP稳定沉默的HL60细胞株.二代测序筛选出明显差异的mRNA及miRNA(P<0.05).Pathway显著性富集分析发现表达下调的基因与氨基酸合成,癌症转录调节紊乱,氨基酸代谢等相关的KEGG pathway有关,详见后述;沉默RYBP后,SPI1与hsa-miR-214-3p均表达降低(P<0.05).结论 RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因可能为:BBC3、BAI1、SESN2、CCNG2、JAK3、STAT4、SPI1、BCL6、CD11b和hsa-miR-214-3p.
关键词：RYBP白血病二代测序靶基因
资助基金：广东省自然科学基金(2014A030313676)中华医学会临床医学科研专项(16010050621)广州市科技计划(201508020254)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 2620-2625 )
英文信息