rno-miR-16-5p靶基因预测、生物信息学分析及鉴定
王芳1
潘茂兴2
蔡三金1
梅志刚1
冯知涛2
1.三峡大学医学院国家中医药管理局中药药理科研三级实验室,湖北宜昌,4430022.三峡大学医学院国家中医药管理局中药药理科研三级实验室,湖北宜昌443002;暨南大学医学院,广州510632
摘要：目的 对rno-miR-16-5p靶基因进行预测、生物信息学分析及鉴定,为深入研究rno-miR-16-5p的生物学功能奠定基础.方法 应用TargetScan、miRDB、miRanda数据库预测出rno-miR-16-5p的靶基因,对靶基因进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析,并利用双荧光素酶报告实验鉴定.结果 3个数据库预测出的交集靶基因有48个,rno-miR-16-5p靶基因主要富集于细胞生长发育、促进突触合成及神经系统发育等生物过程,富集于血小板α颗粒、细胞质动力蛋白复合体等细胞组件与粘多糖分子功能中.信号通路则显著富集于唾液分泌通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路与胰腺分泌通路.双荧光素酶报告实验结果提示脑源性神经营养因子(BDNF)是rno-miR-16-5p的靶基因.结论 rno-miR-16-5p靶向作用于BDNF的表达,可能通过参与cAMP信号通路促进神经系统发育的生物学过程.
关键词：rno-miR-16-5p靶基因生物信息学脑源性神经营养因子信号通路
资助基金：广东省自然科学基金(2015A030310067)三峡大学开放基金项目(KJ2018QT006)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 2215-2219 )
英文信息