肺腺癌骨转移癌痛患者外周血转录组学研究
林中原1
王益敏2
张辉2
林世清1
刘德成1
唐可京3
张朝晖3
窦云凌1
1.中山大学附属第一医院麻醉科,广州5100802.广东省第二人民医院麻醉科,广州5103173.中山大学附属第一医院呼吸与危重症医学科,广州510080
摘要:目的 研究肺腺癌骨转移癌痛(metastatic bone pain,MBP)患者外周血转录组学以阐释其发生发展中的关键基因和通路.方法 选择我院呼吸内科肺腺癌骨转移住院患者11例,其中5例患者符合典型骨转移癌痛表现且疼痛视觉模拟评分≥4分(MBP组),6例视觉模拟评分为0分(C组).收集两组患者外周血进行转录组测序,利用R语言筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并进行生物学功能富集分析.对DEGs进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,获得最显著蛋白表达模块及关键基因,并结合TCGA临床数据对关键模块内基因进行生存分析.结果 共获得差异基因共2332个,其中上调基因1647个,下调基因685个.GO和KEGG结果显示,DEGs主要富集在趋化因子转导通路和p53信号转导通路上.通过PPI网络分析及生存分析,筛选出4个关键节点基因(CXCL1、CXCL10、CXCR4和GNG7),其中GNG7与肺腺癌患者生存率密切相关.结论 趋化因子/趋化因子受体CXCL1、CXCL10、CXCR4与GNG7可能作为MBP的重要预测因子和治疗靶点,为临床治疗提供依据.
关键词:肺腺癌骨转移癌痛RNA-seq生物信息学
分类号:R441.1(诊断学)
论文发表日期:2020-11-10
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 2953-2957 )
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实用医学杂志

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北大核心CSTPCD
ISSN:1006-5725
年,卷(期):2020,36(21)
所属栏目:临床研究