宏基因组二代测序在重症肺炎患者病原学中的应用
何德华
刘明
陈启敏
刘旭
贵州医科大学附属医院重症医学科 贵阳550004
摘要：目的 探究重症肺炎患者肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)与传统培养病原学诊断的差异以及mNGS结果对抗生素方案调整的影响.方法 回顾性分析2019年8月至2021年4月于贵州医科大学附属医院重症医学科住院期间,同时送检BALF传统培养和mNGS的重症肺炎患者.比较两种病原学检测结果的差异,分析mNGS与传统培养诊断的阳性率、一致性及抗生素方案的调整.结果 研究期间共纳入患者75例,其中mNGS的阳性率为97.3％,传统培养阳性率为41.3％;mNGS细菌的检出率为94.7％,传统培养细菌检出率为38.7％;mNGS真菌检出次数最多的为耶氏肺孢子菌24.0％.mNGS对于罕见菌、不典型菌、真菌以及病毒的阳性率远高于传统培养.两组病原学检测结果一致性差(Kappa=0.038,P=0.229),mNGS较传统培养检出更多种类的微生物.基于mNGS检测结果,临床医生对于69％的患者进行抗生素方案的调整.结论 mNGS在重症肺炎患者病原学诊断中敏感性高,对于免疫抑制重症肺炎患者尤为适用.同时,mNGS可以指导临床医师调整抗生素策略.
关键词：宏基因组二代测序重症肺炎病原学抗生素策略
分类号：R563.1(呼吸系及胸部疾病)
资助基金：国家重点研发计划(2018YFC2001904)国家自然科学基金(81960357)国家自然科学基金(81701958)贵州省科技计划项目(2020)1Y330;ZK(2022)吴阶平医学基金会临床科研专项资助基金项目(320.6750.18001)
论文发表日期：2023-04-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 948-952 )
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