基于内质网应激应答的胶质瘤风险模型构建
帕拉沙提·斯然1
王涛2
陈珂1
周嘉懿2
徐健蓉1
李宁宁2
1.西南科技大学生命科学与工程学院(四川绵阳 621010)2.中山大学附属第七医院托马斯·林达尔诺奖科学家实验室(广东深圳 518107)
摘要：目的 探索内质网应激应答(ERS)相关调控基因表达对胶质瘤(不包括胶质瘤母细胞瘤)病理分级、预后和恶性进展表型的预测价值.方法 排除重复和无生存期的样本后,分别选取美国癌症基因组图谱和中国脑胶质瘤基因组图谱中胶质瘤临床样本测序数据作为训练集和验证集.通过差异基因富集和蛋白互作分析,构建与预后相关的ERS风险回归模型.ROC曲线分析、实时荧光定量PCR和免疫组化验证该模型对胶质瘤预后及恶性进展表型的预测价值.结果 研究结果显示,7个ERS相关风险因子表达随胶质瘤级别上升而上调,并精准预测患者不良预后(在1、3和5年预测准确度均高于0.7),差异均有统计学意义.进一步验证显示,ERS风险基因与胶质瘤恶性表型标志物CD44呈正相关,与临床有利预后标志物GPR158呈负相关(P<0.05).最后,临床样本的基因表达和免疫组化分析证实,ERS相关风险因子在较高级别胶质瘤中高表达,与CD44表达量呈正相关(P<0.05).结论 基于ERS应答的风险回归模型具备病理分级和预后的能力,并与胶质瘤的恶性进展表型呈正相关,可为胶质瘤精准靶向诊疗提供参考.
关键词：胶质瘤内质网应激恶性进展表型基因特征
分类号：R739.41(神经系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(82072766)
论文发表日期：2023-11-10
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 2775-2782 )
英文信息