广西结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药基因突变特征
刘港1
蓝如束2
覃慧芳3
秦小玲1
秦翊翔1
徐若兰1
罗丹1
1.广西中医药大学公共卫生与管理学院(南宁 530200)2.广西江滨医院检验科(南宁 530021)3.广西壮族自治区疾病预防控制中心结核病防制所(南宁 530021)
摘要:目的 了解广西壮族自治区结核分枝杆菌乙胺丁醇(EMB)耐药基因突变特征及其影响因素,为结核病的分子诊断和临床治疗用药提供依据.方法 对2018-2019年广西30个结核病耐药监测点连续不间断收集的655株结核分枝杆菌(其中52株乙胺丁醇耐药菌株,603株乙胺丁醇敏感菌株)进行全基因组测序,分析乙胺丁醇耐药基因突变特征及其影响因素.结果 655株结核分枝杆菌中,54株发生乙胺丁醇耐药基因突变,突变率为8.24%(54/655).在比例法检测EMB耐药的52株菌株中,21株发生基因突变,突变率为40.38%(21/52);603株EMB敏感株中,33株发生基因突变,突变率为5.47%(33/603),耐药株中的基因突变率高于敏感株(χ2 = 77.133,P = 0.000).EMB耐药表型与基因突变的符合率为40.38%(21/52),二者检测结果吻合度不高(Kappa值 = 0.343,P<0.001).54株发生基因突变的菌株,突变基因为embA、embB和embC,突变形式有20种,其中单位点突变29株,占53.70%(29/54),联合位点突变25株,占46.30%(25/54).单位点突变中,突变比例最高的位点为embB306(35.19%),其次为embB497(5.56%)和embB406(3.70%).联合位点突变中,突变比例最高的位点为embC270+embB378(22.22%),其次为embB306+embA-12(3.70%).性别、抗结核治疗史、基因型以及是否耐多药可能与EMB基因突变有关(χ2 =9.388,P = 0.004;χ2 = 27.084,P = 0.000;χ2 = 6.671,P = 0.010;χ2 = 68.826,P = 0.000).多因素logistic回归分析结果显示男性(OR = 6.150)、复治(OR = 2.636)和耐多药(OR = 7.333)可能是EMB耐药基因突变的危险因素,北京基因型可能是EMB耐药基因突变的保护因素(OR = 0.511).结论 结核分枝杆菌EMB耐药性与embA、embB和embC基因突变有关,EMB耐药表型与基因突变吻合率不高.对于男性、复治、耐多药以及非北京基因型菌株感染的结核病患者,应关注其EMB耐药基因突变的情况.
关键词:广西结核分枝杆菌乙胺丁醇突变全基因测序
分类号:R52(结核病)
资助基金:广西自然科学基金面上项目(2017GXNSFAA198330)广西中医药大学博士科研启动项目(2017BS004)广西中医药大学硕士研究生科研创新项目(YCSW2021226)广西中医药大学硕士研究生科研创新项目(YCSY2022014)
论文发表日期:2023-12-25
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 3261-3266 )
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