m1A/m5C/m6A/m7G调控基因预测胃癌预后及免疫关联性
陈小梅1
王安奇1
杨积祯2
于淼3
1.甘肃省人民医院国家胃肠肿瘤诊治重点实验室(兰州 730000);甘肃省人民医院临床研究与转化医学研究所(兰州 730000)2.甘肃省人民医院超声医学科(兰州 730000)3.甘肃省人民医院国家胃肠肿瘤诊治重点实验室(兰州 730000)
摘要：目的 基于m1A/m5C/m6A/m7G甲基化调控基因建立胃癌预后风险预测模型,并分析该模型与免疫的关联性.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)-胃癌数据集筛选表达具有显著差异的m1A/m5C/m6A/m7G调控基因,通过单基因Cox回归分析和LASSO算法构建预后风险评分(risk score,RS)模型,使用Kaplan-Meier(K-M)统计进行RS模型验证,并应用细胞系进行RT-qPCR验证.利用单因素、多因素Cox回归分析建立nomogram模型.使用CIBERSORT算法和estimate包进行免疫关联性分析.结果 建立了基于八个甲基化调控基因的预后RS模型,将胃癌患者分为高风险和低风险.这八个基因在胃癌细胞系中高表达(P＜0.05).在TCGA-胃癌训练集和GSE62254-验证集中,患者总生存率(OS)与分组状态之间存在显著相关性(P＜0.001).nomogram生存模型预测的1年(C-index=0.703)、3年(C-index=0.729)和5年(C-index=0.734)生存率与实际生存率的一致性较好.免疫关联性分析表明,与低风险患者组相比,高风险患者组免疫评分和免疫检查点相关基因的表达较高(P＜0.05).结论 基于m1A/m5C/m6A/m7G调控基因的预后RS模型可预测胃癌预后并指导个体免疫治疗决策.
关键词：m1Am5Cm6Am7G胃癌预后免疫浸润
分类号：R735.2(消化系肿瘤)
资助基金：博士后科学基金(NHCDP2022014)甘肃省自然科学基金资助项目(23JRRA1770)甘肃省人民医院院内基金青年培育资助项目(23GSSYF-16)
论文发表日期：2024-05-10
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 1230-1237 )
英文信息