超级增强子介导GSE1的转录并通过Wnt/β-catenin信号通路促进乳腺癌细胞增殖的机制
杜沛静1
虎恩喜1
陶翔2
曹佳1
王立斌3
1.宁夏医科大学总医院(宁夏 银川 750004);宁夏医科大学第一临床医学院(宁夏 银川 750004)2.宁夏医科大学总医院(宁夏 银川 750004);深圳市南山区人民医院(广东 深圳 518000)3.宁夏医科大学总医院(宁夏 银川 750004);宁夏医科大学第一临床医学院(宁夏 银川 750004);深圳市南山区人民医院(广东 深圳 518000)
摘要：目的 研究超级增强子(super enhancer,SE)调控基因抑制因子1(genetic suppressor element 1,GSE1)表达,及其对乳腺癌细胞MCF-7增殖能力的影响及分子机制.方法 使用GEO数据库中MCF-7细胞的ChIP-seq数据集筛选SE及其驱动的癌基因GSE1;HPA和TCGA数据库分别分析GSE1在泛癌和不同乳腺癌亚型中的表达;GEPIA数据库分析GSE1高表达分组和低表达分组之间乳腺癌患者的总体生存期(overall survival,OS);免疫组织化学染色(immunohistochemistry,IHC)分析GSE1在乳腺癌组织中的表达情况;RT-qPCR验证GSE1在不同乳腺癌细胞中mRNA的表达;使用溴结构域蛋白4(bromodomain-containing protein 4,BRD4)抑制剂JQ1处理MCF-7细胞;构建GSE1干扰载体,进行MCF-7细胞株转染,Western blot评估GSE1干扰表达的效率,通过CCK-8、集落形成实验、划痕愈合实验和Transwell迁移实验评估细胞增殖和迁移情况;String数据库分析GSE1互作蛋白;Western blot检测上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)和Wnt/β-catenin信号通路相关蛋白变化情况.结果 基因组浏览器(integrative genomics viewer,IGV)可视化MCF-7细胞的ChIP-seq数据,明确GSE1作为候选基因;结合Rank Ordering Of Super Enhancers(ROSE)算法预测GSE1的SE区域在MCF-7细胞基因组的位置;使用BRD4抑制剂JQ1处理MCF-7细胞后,GSE1和BRD4表达受到抑制(P<0.05);HPA、TCGA、GEPIA数据库以及IHC分析显示GSE1在乳腺癌中高表达并与乳腺癌患者较差的预后生存期相关(P<0.05);RT-qPCR结果显示GSE1 mRNA在乳腺癌细胞中的表达高于正常乳腺上皮细胞(P<0.05);String数据库分析显示GSE1与Snail(Snai1)密切相关;与对照组相比转染GSE1干扰载体后抑制乳腺癌细胞MCF-7的增殖和迁移,且上皮相关蛋白E-cadherin、Occludin表达升高,而间充质相关蛋白N-cadherin、Snail表达降低(P<0.05);与对照组相比敲低GSE1,Wnt/β-catenin信号通路相关蛋白β-catenin、Wnt-5a、Cyclin-D1表达降低,Axin1蛋白表达升高(P<0.05).结论 SE驱动GSE1并通过Wnt/β-catenin信号通路诱导乳腺癌细胞MCF-7的EMT过程,进而促进增殖和迁移.
关键词：超级增强子基因抑制因子1上皮-间充质转化增殖迁移Wnt/β-catenin信号通路
分类号：R737.9(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(82260610)宁夏自然科学基金重点项目(2023AAC02059)深圳市南山区卫生健康系统科技重大项目(NSZD2024021)深圳市南山区卫生健康系统科技重大项目(NSZD2025002)
论文发表日期：2025-09-25
在线出版日期：2025-09-30（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 2796-2805 )
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