高通量测序分析钙化性肌腱炎患者microRNA表达谱的差异
赵喆
刘建全
邓志钦
李文翠
深圳市第二人民医院深圳大学第一附属医院,广东深圳518035
摘要:目的:探讨microRNA在钙化性肌腱炎(CT)患者中的表达差异.方法:选取2019年10月至2020年5月在深圳市第二人民医院骨科确诊为CT并接受手术治疗的患者4例,每例患者均取其炎症肌腱组织(CT组)及炎旁正常组织(Ctr组),提取总RNA并进行转录组测序,采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术进行深度测序,筛选在两组组织中差异表达的microRNA,并进行功能分析.结果:与正常肌腱组织比较,在P<0.05、log2差异倍数(FC)绝对值≥2条件下,CT组共有760个microRNA表达有显著差异.其中104个microRNA的|log2(FC)|>2,其中24个显著上调,80个显著下调.上调表达最明显的是miR-3529-5p,为5.9136倍.在下调表达最明显的是miR-486-5p,为10.0018倍.该类microRNA调控的COL1A1、GOLGA2、S100A16、SOX9、FOXO1等靶基因与离子结合和转运、钙通道活性、蛋白激酶活性和代谢功能密切相关.结论:CT组织与正常肌腱组织microRNA表达谱存在明显差异,差异表达的microRNA可能在CT的形成中具有重要作用,为继续研究这些microRNA在CT中的作用机制打下基础.
关键词:钙化性肌腱炎microRNA高通量测序生物信息学
分类号:R686.1(骨科学(运动系疾病、矫形外科学))
论文发表日期:2021-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 1-4,封3 )
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