生物信息学筛选活动性肺结核的潜在生物标志物的临床研究
冶学燕1
仝雪薇1
刘春燕2
张新2
1.石河子大学医学院第二附属医院新疆生产建设兵团医院,新疆乌鲁木齐830002;石河子大学医学院,新疆石河子8320002.石河子大学医学院第二附属医院新疆生产建设兵团医院,新疆乌鲁木齐830002
摘要：目的:利用生物信息学技术筛选活动性肺结核(PTB)诊断和治疗监测的潜在生物标志物.方法:通过GEO数据库下载GSE19444和GSE19435基因芯片数据集.利用GEO2R工具筛选活动性PTB患者与健康对照间的差异表达基因(DEG),使用CentiScape插件确定中枢基因(Hub基因),并通过GSE56153数据集验证Hub基因在活动性PTB治疗期间的变化.结果:两个数据集中共筛选505个DEG,上调251个,下调254个.DEG网络的9个子模块中模块1评分最高,包含的25个基因主要参与病毒防御、干扰素信号通路等反应.在25个基因中筛选了 13个Hub基因,通过验证,提示上调的IFIT3、IFI35、STAT1和GBP1在初诊活动性PTB、治疗8周、治疗28周和健康对照组的表达水平有显著降低趋势.结论:筛选出的IFIT3、IFI35、STAT1和GBP1与活动性PTB的发生和治疗密切相关,有望成为PTB诊断和治疗监测的潜在生物标志物.
关键词：肺结核结核分枝杆菌生物信息学差异表达基因
分类号：R521(结核病)
资助基金：新疆生产建设兵团医院科研项目(2018010)兵团科技攻关计划(2018AB024)
论文发表日期：2021-06-16
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 9-12,后插2,封3 )
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