荧光PCR熔解曲线法快速鉴定痰标本中分枝杆菌菌种的临床应用价值
陈新朝
陈晓红
许榕青
黄明翔
福州肺科医院,福建福州350008
摘要:目的:研究荧光聚合酶链式反应(PCR)熔解曲线法快速鉴定痰标本中分枝杆菌菌种的临床应用价值.方法:采集福州肺科医院2018年1月至2019年12月经BACTEC MGIT 960系统液体培养阳性的558株疑似非结核分枝杆菌(NTM)临床分离菌株.对所有菌株均开展荧光PCR熔解曲线及16S核糖体核糖核酸(rRNA)基因测序法鉴定.将16S rRNA基因测序结果作为标准,采用荧光PCR熔解曲线法鉴定NTM的效能,分析主要NTM的耐药性情况.结果:16S rRNA基因测序法鉴定结果显示,疑似NTM菌种以胞内分枝杆菌(M.胞内)、龟/脓肿分枝杆菌(M.龟/脓肿)、鸟分枝杆菌(M.鸟)、堪萨斯分枝杆菌(M.堪萨斯)及戈登分枝杆菌(M.戈登)为主;荧光PCR熔解曲线法鉴定结果显示,疑似NTM菌种亦以上述5种为主.荧光PCR熔解曲线法鉴定M.龟/脓肿的灵敏度、特异度及准确度为95.7%、100.0%、99.1%;M.胞内的灵敏度、特异度及准确度为100.0%、97.3%、98.7%;M.鸟灵敏度、特异度及准确度为88.7%、100.0%、98.6%;其他NTM菌种的灵敏度、特异度及准确度均为100.0%.一致性分析结果显示:荧光PCR熔解曲线法与基因测序法鉴定各种NTM菌种的一致性在0.81~1.00之间.16SrRNA基因测序法与荧光PCR熔解曲线法鉴定结果不一致菌株共13株,包括5株M.龟/脓肿及8株M.鸟.结论:荧光PCR熔解曲线法快速鉴定痰标本中NTM菌种的效能较佳,与基因测序法存在较高的一致性.
关键词:非结核分枝杆菌聚合酶链式反应熔解曲线法
分类号:R521(结核病)R378.91+1(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
资助基金:福建省福州市科技计划项目(2021-S-194)
论文发表日期:2023-04-16
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 54-57 )
深圳中西医结合杂志

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ISSN:1007-0893
年,卷(期):2023,33(8)
所属栏目:诊断研究