基于生物信息学筛选口腔鳞状细胞癌化疗和预后相关基因
刘晨睿1
田畅1
阳帆2
龙本安3
1.湘潭市第一人民医院放疗科,湖南 湘潭 4111002.湖南医药学院检验学院,湖南 怀化 4180003.湖南医药学院中方医院普外科,湖南 怀化 418000
摘要：目的:口腔鳞状细胞癌(OSCC)起源于鳞状上皮病变,其晚期患者治疗效果和预后均较差.为了进一步提高OSCC的治疗效果,本研究通过GEO和TCGA表达数据库来研究OSCC癌变的潜在分子靶标.方法:从美国国立生物技术信息中心(NCBI)基因表达数据库(GEO)下载与OSCC相关的基因表达数据库系列(GSE)数据集,使用"limma"软件包鉴定差异基因(DEGs),并对DEGs进行通路分析;根据癌症基因组图谱(TCGA)数据库信使核糖核酸(mRNA)表达数据,筛选获得关键候选基因;对候选基因进行随机生存分析、基因集差异分析(GSVA)和药物敏感性分析,评估关键基因与OSCC预后及治疗耐药的相关性.结果:通过GEO数据集,在OSCC组织中共获得7个关键基因;随机生存分析,进一步筛选出PITPNM3、ZYG11A和TBC1D2 这 3 个预后相关基因;PITPNM3 和ZYG11A低表达与患者不良生存期和治疗耐药有关,TBC1D2 低表达的患者生存期较长和药物敏感性增加;Nomogram模型分析显示,PITPNM3、TBC1D2、ZYG11A表达均为患者预后的独立危险因素;临床样本检测显示,这三个基因在顺铂耐药和顺铂敏感组中有显著的差异表达(P<0.05).结论:本研究发现了OSCC患者的 3 个潜在生物标志物,PITPNM3、TBC1D2、ZYG11A表达与患者预后和治疗耐药相关,并且在OSCC中可作为潜在的治疗靶点.
关键词：口腔鳞状细胞癌化疗预后生物信息学相关基因药物敏感性
分类号：R739.8(口腔、颌面部肿瘤)
资助基金：湖南省卫生健康委课题项目(202203105470)湖南省教育厅科学研究项目(22A0697)
论文发表日期：2025-07-15
在线出版日期：2025-10-24（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 11-14,27,后插1-后插4 )
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